1191 год, Ближний Восток. Рыцари крестового похода разоряют Святую Землю. Главный герой - воин из тайного общества убийц, ассасин по имени Альтаир. Его миссия - остановить войну. Он должен устранить ключевые фигуры на обеих сторонах конфликта - и среди крестоносцев, и среди сарацинов. Но чем больше врагов падает к ногам героя, тем яснее он понимает, что стал марионеткой в чужой игре. Он ввязался в конфликт такого масштаба, который угрожает не только Святой Земле, но и существованию всего мира. На людных улицах древнего Иерусалима ассасину предоставлена абсолютная свобода действий. Игрок всегда решает сам, где и каким образом уничтожить намеченную жертву. Ему дозволено всё ради достижения поставленной цели. И каждое действие немедленно отражается на окружающем мире. Толпа людей реагирует на движения героя и в одном случае поможет скрыться от преследования, а в другом - сама набросится на наемного убийцу.